ביולוגיה חישובית ומבנית / חוקרים מובילים בפקולטה

1. הבנת תהליכי הקיפול של חלבונים
2. חקר מולקולות RNA לא מקודדות בטריפנוזומות
3. חקר המרכיב הגנטי במחלות
4. כרית מידע רפואי בשיטות של למידת מכונה

1. ביולוגיה מבנית - קריסטלוגרפיה של מאקרומולקולות
2. תכנון ויצירת תרופות חדשות
3. הכוונת אקסונים - מערכת האיתות Slit-Robo
4. בסיס מולקולרי להתפתחות המוח האנושי

1. למידה עמוקה בביולוגיה חישובית
2. מודלים חישוביים לקשירת חלבון לדנ״א ורנ״א ורגולציית ביטוי גנים
3. ניבוי מבנים של מולקולות דנ״א ורנ״א
4. חיזוי השפעות של וריאנטים על פונקציית חלבון על-סמך מידע רב תפוקה
5. אלגוריתמים לתכנון מחרוזות דנ״א, רנ״א, וחומצות אמינו
6. מבני נתונים ואלגוריתמים לעיבוד יעיל של מידע מריצוף רב-תפוקה

פרופ' לבנון ארז

1. גנומיקה חישובית
2. עריכת רנ"א ע"י האנזים ADAR
3. עריכת דנ"א ע"י האנזים APOBEC
4. מורכבות הטרנסקריפטום
5. אלמנטים ניידים בגנום
6. הקשר של עריכת רנ"א למחלות

פרופ' עפרוני סול

1. רפרטואר תאי הטי
2. ריצוף רנא ברמת התא הבודד
3. רשתות בגנומיקה של סרטן
4. חיזוי תגובה לתרופות באמצעות גנומיקה של סרטן

1. גנומיקה, מטאגנומיקה ואנליזות מידע רצפי
2. פיתוח אלגוריתמים לזיהוי וכימות חיידקים ונגיפים במיקרוביום האנושי
3. חיזוי מחלות באמצעות המיקרוביום האנושי
4. שימוש במודלי שפה לניתוח מידע רצפי
5. בניית רשתות לחקר אינטרקציות בין וירוסים-חיידקים-אדם
6. פיתוח כלים גנומיים לסיווג מחזור החיים של וירוסים בגופינו

1. זיהוי שיבושים בשעתוק ועיבוד רנ״א שמסייעים להתפתחות הסרטן
2. זיהוי ניאואנטיגנים שנוצרים משיבושי רנ״א לשימוש באימונותרפיה
3. אנליזת מידע רצפי ומידע מסריקת תרופות עבור רפואה מותאמת אישית
4. זיהוי נקודות תורפה ייחודיות של תאי סרטן
5. אנליזת רמות ביטוי רנ״א בתאים בודדים להבנת הסרטן והמערכת החיסונית (כולל אנליזת רשתות)

1. גילוי מטבוליטים באמצעות פלטפורמות HPLC ו-LC-MS מתקדמות ברזולוציה גבוהה, בשילוב אנליזות חישוביות מתקדמות
2. זיהוי מטבוליטים בעלי פעילות ביולוגית הנוצרים בממשק שבין תזונה–מיקרוביום המעי–והמאחסן, עם דגש על מטבוליטים ממזונות ממקור צמחי (פיטוכימיקלים)
3. הבנת האופן שבו תזונה והמיקרוביום מעצבים את תפקוד הכבד
4. חשיפת מנגנונים שבאמצעותם אינטראקציות בין תזונה למיקרוביום משפיעות על התפתחות סרטן ותגובה לטיפול